Вот что получилось:
141.8.183.17 - - [27/Dec/2016:17:10:06 +0500] "GET / HTTP/1.1" 200 12327 "-" "Mozilla/5.0 (compatible; YandexMetrika/2.0; +http://yandex.com/bots yabs01)" "-" unix:/var/www/php-fpm/site.sock "0.047"
93.158.152.83 - - [27/Dec/2016:17:10:10 +0500] "GET /meter HTTP/1.1" 200 16054 "-" "Mozilla/5.0 (compatible; YandexImages/3.0; +http://yandex.com/bots)" "-" unix:/var/www/php-fpm/site.sock "0.069"

Здесь фиксируется время выполнения кода php, а как узнать время от получения запроса сервером nginx до его выдачи (ведь могут быть различные задержки)?