> Что мешает реализовать данную функциональность в приложении?
> Например, используя тот же упомянутый uWebSockets.js?

Нам мешают те же причины что у вас, бизнесу выгодно чтобы мы писали больше бизнес логики и меньше писали инфрастуктурного кода.
Да, можно сделать распределеную систему на Pub/Sub от Redis и uWebSockets.js будет раздавать клиентам сообщения, но это медленей и в лучшем случаи мы сделаем тоже что уже написано в nchan.

> Дело в том, что задача достаточно узкоспециализированная

Не уверен, из своего опыта даже сложно вспомнить какие задачи помещались в рамки связи один к одному, обычно один ко многим.
Даже если у нас один сервер, у него будет множество процессов, два клиента WebSocket законектися к разным процессам, вот уже связь один ко многим.

Киллер фича Unit, которой нет в nchan, заключается в том что Unit знает про все application и умеет с ними общатся без сети, это большой потенциал, я бы очень хотел чтобы мои процессы внутри сервера могли общатся через Unit без сети.