В логах такая вот ошибка:
2015/06/16 17:52:47 [error] 20016#0: *17 open() "/home/bitrix/www/phpMyAdmin/themes/original/img/logo_right.png" failed (2: No such file or directory), client: 178.248.69.58, server: _, request: "GET /phpMyAdmin/themes/original/img/logo_right.png HTTP/1.1", host: "site.ru", referrer: "https://site.ru/phpMyAdmin/phpmyadmin.css.php?nocache=5735254046ltr"
Не пойму почему путь по которому открывается файл находиться в папке битрикса, а не в /usr/share...