по пунктам ваших вопросов обьяснять очень много проще за вас все
сделать но попытаюсь карму себе почистить:

1. вам надо выделить там суть - например настройки по кол-ву заросов и
логгированию в файл "плохих" запросов, а лудше по каждому пункту
заглянуть в доки и решить надо ли вам оно.
2 этот файл содержит настройки для линка к апачу то есть положить его
опять таки куда угодно но не забыить прилинковать к основным
настройкам
3 сам скрипт можно куда угодно главное его переодически запускать

Однако php скрипт который
>Парсит лог файлы nginx`a, подсчитывает общее кол-во запросов к нему от разных IP,
это не хороший путь
лудше реализовать другими средствами например

http://sysoev.ru/nginx/docs/http/ngx_http_limit_zone_module.html
http://www.opennet.ru/tips/info/367.shtml

Кроме того вызывает недоумение зачем вам на слабом впс еще и апач -
одно дело у вас без него сервисы не работают другое просто незнаете
что nginx и какой нить spawn-php(fcgi) позволяет сделать все то же
самое с минмальными изменениями скриптов(или даже без изменений)

еще совет внятно сформулируйте что хотите сделать и наймите админа он
за час вам все настроит
_______________________________________________
nginx-ru mailing list
nginx-ru@nginx.org
http://nginx.org/mailman/listinfo/nginx-ru