Аналогичная ситуация, при включённом aio одновременно с mp4 nginx 1.1.6 с http_mp4_module, проблема решается отключением aio. Кстати, ровно та же проблема наблюдалась и с nginx_mod_h264_streaming от http://h264.code-shop.comby bsyomov - Nginx Mailing List - Russian