Поставил апдейты на Ubuntu сервер
Linux version 2.6.31-302-ec2 (gcc version 4.4.1 (Ubuntu 4.4.1-4ubuntu7) ) #7-Ubuntu SMP Tue Oct 13 19:06:04 UTC 2009

После этого стали частенько вываливаться upstream timed out. Включил предыдущую версию без апдейтов - все нормально. Конфиг nginx-а не менялся.
Может кто посоветует куда копать и что смотреть.

Спасибо