Я попробовал собрать nginx 1.15.5 checkinstall 1.6.2 в итоге в системе (ubuntu 16.04.05x64) не видно nginx.
скрин: https://bit.ly/2yus5aE
Ни при выполнении
./configure \
--prefix=/usr/share/nginx \
--conf-path=/etc/nginx/nginx.conf \
--http-log-path=/var/log/nginx/access.log \
--error-log-path=/var/log/nginx/error.log \
--lock-path=/var/lock/nginx.lock \
--pid-path=/run/nginx.pid \
--modules-path=/usr/lib/nginx/modules \
--http-client-body-temp-path=/var/lib/nginx/body \
--http-fastcgi-temp-path=/var/lib/nginx/fastcgi \
--http-proxy-temp-path=/var/lib/nginx/proxy \
--http-scgi-temp-path=/var/lib/nginx/scgi \
--http-uwsgi-temp-path=/var/lib/nginx/uwsgi \
--with-debug \
--with-pcre-jit \
--with-http_stub_status_module \
--with-http_realip_module \
--with-http_auth_request_module \
--with-http_v2_module \
--with-http_dav_module \
--with-http_slice_module \
--with-threads \
--with-http_addition_module \
--with-http_geoip_module=dynamic \
--with-http_gunzip_module \
--with-http_gzip_static_module \
--with-http_sub_module \
--with-http_xslt_module=dynamic \
--with-stream=dynamic \
--with-mail=dynamic

ни при make ошибок не было обнаружено.
Подскажите, пожалуйста, в чем может быть причина?