> Т.е. директиву client_body_in_file_only и переменную
> $request_body_file добавили, а
> прав на файлы - добавить забыли.

Да, в интернете многие задаются вопросом почему сделано это так, похоже что просто забыли учитывать client_body_in_file_only.