затрудняюсь ответить, вставили от безысходности. на данный момент добились таких результатов:
создавая папку с таким же именем, как в location то всё работает, иначе не работает.

сейчас конфиг такой:

server {
listen 80;
server_name test.loc;
root /var/www/test;

error_log /var/log/nginx/mytest.log;
index index.html index.php;

location / {

index index.html index.php;
#try_files $uri $uri/ /index.php?$args;
set $root /var/www/test;
}

location /qqq {

index index.html index.php;
#try_files $uri $uri/ /index.php?$args;
alias /var/www/test2;


location ~ \.php$ {
include fastcgi_params;
fastcgi_param PATH_INFO $fastcgi_path_info;
fastcgi_index index.php;
fastcgi_param PATH_TRANSLATED $document_root$fastcgi_script_name;
fastcgi_param SCRIPT_FILENAME $document_root$fastcgi_script_name;
fastcgi_pass 127.0.0.1:9000;
}
}

location ~ \.php$ {

include fastcgi_params;
fastcgi_param PATH_INFO $fastcgi_path_info;
fastcgi_index index.php;
fastcgi_param PATH_TRANSLATED $document_root$fastcgi_script_name;
fastcgi_param SCRIPT_FILENAME $document_root$fastcgi_script_name;
fastcgi_pass 127.0.0.1:9000;
}

}

по этому урлу http://test.loc/qqq/ сейчас ошибка "File not found."