Да, в принципе его не стоит оставлять.
Статику в отдельную директорию конечно самое логичное, но меня подключили к проекту после того как все написано было.
Сейчас что-либо менять будет достаточно сложно, но я скажу проггерам.

Если рассматривать идеальный вариант, может ли данный конфиг сойти за таковой? Ну или считать близким ;-)

#тут поставил пустую директорию, или надо вообще не указывать root ?
root /var/www/directory1;
index index.php; #возможно index тоже необязателен. поставил для галочки.

location / {
try_files "" /index.php;
}

location = /index.php {
fastcgi_pass 127.0.0.1:9000;
fastcgi_param SCRIPT_FILENAME /var/www/framework/index.php;
include fastcgi_params;
}

# статика общая для нескольких проектов под одним фреймворком, поэтому вынесена в другую директорию
location ~ /(js|css|img)/ {
root /var/www/directory2;
access_log off;
}


Спасибо!