попробуй плеер JWplayer 5.9 он реально простой, хотя может быть у тебя проблемы в настройках конфига (а лучше почитай документацию) там есть все ответы, как не странно. Да еще забыл добавить решение я нашел в win32 а не в linux может что-то криво скомпилировал.

на сколько я знаю(предполагаю):
1) к вопросу есть ответ в документации
2) к этому вопросы я рекомендую mp4box
3) без разницы на сколько я понял.

^^об этому серьезно не нужно размышлять я только предполагаю.