В том то и дело, что upstream keepalive в конфиге у данных пользователей нет.

Проверено, что без данного патча и модуля, с теми же конфигами, на том же железе проблем не возникает.

Сейчас попрошу проверить как обстоят дела с patch-nginx-keepalive-full-5.txt , по результатам отпишусь.