Вообщем суть в том что на сайт пришло сразу около 6 поисковых ботов. Хотя delay и был выставлен между запросами, как-то не очень помогало. Было очень много записей файлов сессий в tmp. Начал писать проверку user_agent для того чтобы вкл. сессию или нет.
Потому что в конечном итоге сессия даже не создавалась, писалась ошибка в php-fpm.log

У backlog ставил 1024, не помагало.
Увеличил ulimit - n 10000 октрытых файлов, тоже не помогло.

net.core.somaxconn = 128 - на скольки увеличить.

Я пока что убрал индексацию, потому что сервер в облаке находится и боты тупо сжирали дофига ОЗУ и постоянно писались логи, доходили до 4 гигов лога.