Выкрутился следующим способом.
location = /index.php {
if ( $is_args != "?" ) {
rewrite ^/index.php$ http://адрес/ permanent;
}
root /home/services/www;
fastcgi_pass phpfcgi;
fastcgi_param SCRIPT_FILENAME /home/services/www/index.php;
include fastcgi_params;
}