Есть ли вариант, используя модуль ngx_http_addition_module, указывать в значении URI веб адрес (URL, например http/site.ru/pluscode.html) либо задавать путь к добавочному файлу который лежал бы в универсальном хранилище, например в /root/nginx/pluscode.html

Сейчас как я понимаю, он может лежать только в директории сайта вида
/home/user/public_html/pluscode.html
и ни в каком другом месте.

варианты вида
add_before_body http://site.ru/pluscode.html
add_before_body /home/nginx/pluscode.html

не срабатывают.