Увеличил наконец-то серверу RAM до 6Gb (было 2Gb) и заменил диски с SAS на SATA бОльшего объема.
Серверу стало гораздо комфортнее, производительность работы увеличилась, как и стабильность.
Nginx стал быстро отдавать статику и держит до 200-500 коннектов (больше видимо не лезет).
Apache держит легко 70 процессов (в конфиге стоит MaxClient 70).
Возможно диски еще были уже тормознутые, возможно память сыграла ключевую роль - турдно сказать
Но всем спасибо за советы!