>
> А что бы в логах ?
>

Я не совсем вопрос понял. :-)
Было бы хорошо, если бы в логе была ошибка о том что конфиг не распарсился из-за too many open files.
А так там ничего не было.
Правда может надо было увеличить info для error.log, был он такой:
error_log /var/log/nginx/error.log;